การฉีดโบท็อกซ์แม้จะออกฤทธิ์คลายกล้ามเนื้อและเกิดผลลัพธ์ที่ดีตามมามากมาย แต่ยังมีบางบริเวณที่ไม่แนะนำให้ฉีดโบท็อกซ์หรือควรฉีดด้วยความระมัดระวัง ได้แก่

1. บริเวณเปลือกตา ; กล้ามเนื้อบริเวณนี้มีหน้าที่ในการเปิดเปลือกตาขึ้น หรือลืมตา หากฉีดโบท็อกซ์บริเวณนี้จะทำให้หนังตาตกได้
2. เหนือคิ้ว ; เป็นหนึงในบริเวณที่ฉีดเพื่อปรับทรงคิ้วให้ดูยกขึ้น แต่หากฉีดผิดตำแหน่งจะทำให้หนังตาและคิ้วตกลงมาได้
3. โบท็อกซ์ริ้วรอยใต้ตา ; บริเวณนี้แนะนำฉีดในปริมาณที่น้อยเพื่อลดริ้วรอยบริเวณใต้ตา แต่ไม่แนะนำในคนไข้ที่มีปัญหาถุงใต้ตาหย่อนคล้อย เพราะจะทำให้เห็นถุงใต้ตาชัดขึ้น
4. โหนกแก้ม ; บริเวณนี้เป็นวิธีการฉีดลิฟหน้าเพื่อให้ผิวช่วงโหนกแก้มดูกระชับขึ้น แต่หากฉีดผิดตำแหน่งอาจไปโดนกล้ามเนื้อในการฉีกยิ้มทำให้ยิ้มเบี้ยวได้
5. ร่องแก้ม ; หนึ่งในสาเหตุที่ทำให้เกิดร่องแก้มชัดคือกล้ามเนื้อฉีกยิ้มแต่ไม่แนะนำฉีดโบท็อกซ์ในการแก้ไขปัญหาร่องแก้ม เนื่องจากจะทำให้ยิ้มไม่ออก และรอยยิ้มเปลี่ยนไปดูไม่เป็นธรรมชาติ
6. ร่องมุมปาก ; เป็นบริเวณที่ฉีดโบท็อกซ์เพื่อให้มุมปากยกขึ้น ลดร่องน้ำหมาก แต่หากฉีดผิดบริเวณหรือปริมาณมากเกินไปอาจทำให้ปากเบี้ยวได้